為加強林業生態工程建設資金管理，提高財政資金使用效益，根據《中中華人民共和國預算法》、《基本建設財務管理規定》（財建［2007］394號）等有關法律、法規和規章製度，結合林業生態工程特點，國家林業局聯合財政部製定下發了《林業生態工程建設資金管理辦法》（財建［2007］525號），印發各省、自治區、直轄市、計劃單列市財政廳（局）、林業廳（局），新疆生產建設兵團財務局、林業局及國家林業局各直屬單位執行。該辦法明確了生態工程建設資金的使用範圍、預算管理及會計核算等事項。該辦法下發後，原《林業重點生態工程建設資金管理暫行規定》（林計發［2002］261號）、《重點地區天然林資源保護工程建設資金管理規定》（財基字［1999］92號）同時廢止。