根據《中華人民共和國審計法》第二十七條的規定和審計署2006年審計工作計劃，審計署於6月7日對國家林業局下達了“專項審計調查通知書”，自6月中旬開始派專項審計調查組對國家林業局組織實施天保工程以及天保工程資金的管理、撥付等情況進行專項審計調查。
   　　6月19日下午，審計署農業與資源環保審計司翟挨才副司長一行四人到國家林業局就天保工程審計調查前的有關情況與計資司、資源司、天保辦等單位進行了座談，翟挨才副司長就審計調查的目的、時間、範圍、內容作了具體說明。計資司、資源司、天保辦的有關領導參加了座談會並表示對審計調查組的工作給予全力配合和支持。